Biokemiallisilla tuotteilla tarkoitetaan erilaisia biokemiallisten reaktioiden kautta saatuja aineita. Niiden soveltamisalaan kuuluvat itse mikro-organismit, mikro-organismien tuottamat sekundaariset metaboliitit ja mikrobi-organismien syntetisoimat entsyymit. Lisäksi biokemialliset tuotteet sisältävät hyödyllisiä aineita, jotka muodostuvat entsyymikatalysoidun substraattikonversion kautta, sekä tuotteita, jotka syntyvät substraattien mikrobifermentoinnista käytännön hyödykkeiksi.
Erityissovellusten osalta biokemialliset tuotteet ovat erilaisia; yleisiä luokkia ovat lääketieteellisessä diagnostiikassa käytettävät biokemialliset reagenssit ja instrumentit, puhtaana energialähteenä toimiva polttoaineetanoli sekä elintarvike- ja kemianteollisuuden raaka-aineina käytettävät orgaaniset hapot ja niiden johdannaiset.
